精神科病院（診療所）または一般病院（診療所）が主な勤務先となります。公認心理師は医師からの依頼を受けて心理査定（アセスメント）や心理療法をおこなうほか、必要に応じてクライエントの家族に対する心理支援もおこないます。

発達障害を筆頭に知的障害、精神障害、虐待、不登校、子育て全般といった障がい児に関する相談が多く、児童相談所では「児童心理司」「心理判定員」などの名前で呼ばれ、児童虐待の対応、発達障害・療育手帳に関する判定や相談に応じます。児童福祉施設では障がい児を対象とした療育や家族支援が中心となります。

スクールカウンセラーとして小中高校で働いたり、学生相談室、教育委員会などに所属し、学校生活の質の維持向上のための援助します。不登校やいじめの問題、友人関係、発達障害や精神疾患の疑いなど、様々な問題について、教員や医療機関などと協力しながらアセスメントや心理面接、家族面接、コンサルテーションなどを行います。

少年鑑別所、少年院、警察関係機関などが主な勤務先であり、事件を起こした容疑者の心理査定を通じた処遇方針の決定や、更生に向けた心理療法に取り組みます。また、裁判後の被害者支援に取り組むこともあります。

企業内外の健康管理・相談室に勤務し、会社員や公務員など働く人のメンタルヘルスを支援します。仕事上の悩みの相談や、過労や精神疾患などによる休職者の職場復帰の支援、必要に応じた家族や上司へのコンサルテーション、従業員を対象としたストレスチェックの実施、職場全体の健康増進の啓発などを担当します。